Какие преимущества и ограничения метода петлевой изотермической амплификации LAMP по сравнению с другими методами молекулярной диагностики?

Некоторые преимущества метода петлевой изотермической амплификации (LAMP) по сравнению с другими методами молекулярной диагностики:

• Простота в исполнении и низкая стоимость. microbiol.crie.ru en.wikipedia.org Для реакции не требуется сложное оборудование, а используемые методы детекции не включают флюоресцентно-меченые зонды. molmedjournal.ru
• Высокая аналитическая чувствительность. molmedjournal.ru Минимальное количество копий ДНК/РНК, которое может быть определено в единице объёма пробы, равно или превышает таковое у аналогичной полимеразной цепной реакции (ПЦР). molmedjournal.ru
• Высокая специфичность реакции. molmedjournal.ru Амплификация происходит только при распознавании праймерами определённых участков мишени. molmedjournal.ru Такой подход позволяет проводить определение вирусных генотипов и однонуклеотидных замен. molmedjournal.ru
• Сокращение времени реакции. molmedjournal.ru Это происходит за счёт уменьшения потерь на нагревание/охлаждение прибора и повышения эффективности реакции вследствие её непрерывного течения в изотермических условиях. molmedjournal.ru
• Устойчивость к примесям. cyberleninka.ru LAMP менее чувствительна к примесям при выделении нуклеиновых кислот, чем ПЦР. cyberleninka.ru

Некоторые ограничения метода LAMP:

• Сложность конструирования праймеров. microbiol.crie.ru cyberleninka.ru Необходимо подобрать сразу 6–8 участков на достаточно коротком фрагменте ДНК и избежать при этом амплифицирования других (нежелательных) её последовательностей, особенно в геноме хозяина. microbiol.crie.ru
• Проблемы с оптимизацией условий реакции. microbiol.crie.ru Рекомендации относительно оптимизации изотермических реакций амплификации подробно не разработаны, в отличие от ПЦР. microbiol.crie.ru
• Ограничения в мультиплексировании. microbiol.crie.ru en.wikipedia.org Подходы к мультиплексированию для LAMP менее развиты, чем для ПЦР. microbiol.crie.ru en.wikipedia.org
• Трудности в специфической детекции продуктов амплификации ДНК. microbiol.crie.ru Из-за использования большого количества праймеров (4–6 праймеров на реакцию), два из которых являются чрезмерно длинными, могут появиться ложноположительные сигналы. obolensk.org