Преимущества создания чистой базы данных в 1С:

• возможность ведения учёта во вновь созданной или реорганизованной организации; 3
• использование в тестовых целях. 3

Недостатки:

• Для файловой базы данных:
• снижение быстродействия при размерах базы свыше 6–10 Гб; 1
• наличие блокировок базы данных при одновременном обращении к ней; 1
• вычисления происходят на компьютере пользователя, что повышает требования к комплектующим каждого рабочего места; 1
• не работают регламентные задания в случае отсутствия активных пользователей; 1
• свободный доступ к файлу базы данных пользователями, что небезопасно; 1
• низкая отказоустойчивость. 1

Для клиент-серверной базы данных:

• распределение нагрузки за счёт использования Сервера 1С; 1
• широкие возможности по созданию резервных копий базы данных; 1
• высокая отказоустойчивость; 1
• работа регламентных заданий даже при отсутствии активных пользователей; 1
• практически нет ограничения по размеру базы данных; 1
• при одновременной работе нескольких пользователей на порядок выше производительность по сравнению с файловой базой; 1
• низкие требования к комплектующим клиентских компьютеров, так как все вычисления производятся на сервере; 1
• нет свободного доступа к базе данных. 1

Выбор между преимуществами и недостатками зависит от конкретных условий и требований к базе данных.