Преимущества использования масс-спектрометрии для измерения молекулярных масс:

• Чувствительность. 23 Для получения достоверного масс-спектра индивидуального соединения достаточно 10–9–10–10 г вещества. 3
• Универсальность. 1 Возможность анализа широкого круга объектов от элементов до сложных белковых молекул. 1
• Мягкий метод ионизации. 1 Молекуле образца передаётся около 5 эВ избыточной энергии, что препятствует процессам фрагментации и позволяет подвергать анализу нестойкие молекулы. 1

Недостатки использования масс-спектрометрии для измерения молекулярных масс:

• Деструктивный метод анализа. 14 Используемый образец нельзя восстановить для дальнейшего анализа или синтеза. 1
• Простые масс-спектры. 1 Не позволяют судить о структуре вещества и сравнить спектр с базами масс-спектральных данных. 1
• Возможность анализа только тех соединений, которые можно перенести в газовую фазу (испарить). 1