Способность к горизонтальному переносу генов даёт плазмидам следующие преимущества:

• Снижение зависимости от клетки-хозяина. 1 Это расширяет спектр возможных хозяев, что способствует межвидовому переносу генетического материала. 1
• Обеспечение новых метаболических путей. 3 Например, плазмиды могут содержать гены, ответственные за сбраживание разных сахаров, гидролиз мочевины или образование сероводорода. 3
• Возможность разрушать потенциально токсичные соединения. 3 Например, плазмиды могут содержать гены ферментов, которые превращают циклические углеводороды толуол и ксилол в бензоат и дают возможность бактериям разлагать вредные для окружающей среды соединения. 3
• Повышение приспособленности бактерий к окружающей среде. 3 Например, плазмиды могут обеспечивать устойчивость к антибиотикам. 3