Некоторые преимущества, которые даёт голосеменным растениям наличие семязачатка:

• Независимость оплодотворения от воды. 3 Внутри семязачатка происходит процесс оплодотворения и развитие зародыша, что обеспечивает автономность этого процесса. 3
• Защита зародыша. 2 Плотные оболочки семязачатка эффективно защищают семя от неблагоприятных природных факторов, многие из которых губительны для большинства спор. 2
• Повышение выживаемости потомства. 1 В семени есть не только сформированный зародыш, но и запас питательных веществ, необходимый на первых этапах его развития. 2
• Возможность произрастания в неблагоприятных условиях. 1 Голосеменные растения могут обитать в местах, где обитание споровых невозможно, например, на холодных и засушливых территориях. 1
• Эффективное расселение. 3 Семязачаток превращается в семя — основную единицу расселения семенных растений. 3 Семена при созревании отделяются от материнского растения и обычно имеют разнообразные приспособления для распространения. 2