Появление устойчивых к ядохимикатам микроорганизмов имеет следующие негативные последствия для сельского хозяйства:

• Снижение эффективности ядохимикатов. 24 Даже если после действия препарата погибает много вредителей, оставшиеся устойчивые экземпляры дают потомство с повышенной стойкостью к ядохимикату. 3 Это потомство уничтожает культурные растения, снижая урожай. 3
• Необходимость разработки новых препаратов. 45 Это влечёт за собой дополнительные затраты на их разработку, цены на новые препараты становятся выше, а следовательно, повышаются затраты на производство сельхозпродукции и её стоимость. 4
• Нарушение баланса экосистемы. 4 После уничтожения одного вида организмов освободившаяся экологическая ниша не будет пустовать, и на место уничтоженных могут прийти такие же с соседних территорий или совсем другие виды, которые могут быть ещё более опасны для сельскохозяйственных культур. 4

Главная причина возникновения устойчивости к токсинам — многократные обработки одним и тем же действующим веществом. 2