Некоторые особенности строения клювоголовых, которые делают их уникальными среди современных пресмыкающихся:

• Развитый теменной глаз. 14 Это пузыревидный орган, имеющий слой светочувствительных клеток и подобие хрусталика. 2 Он помогает животному регулировать температуру тела путём выбора места и позы по отношению к солнечным лучам. 2
• Кинетизм черепа. 2 Верхняя челюсть, нёбо и крыша черепа подвижны относительно мозговой коробки (по крайней мере у молодых особей). 2 Это явление служит для лучшего удержания схваченной добычи в челюстях хищника и может обеспечивать амортизацию удара челюстей и рывков добычи. 2
• Примитивное двояковогнутое (амфицельное) строение позвонков. 24
• Наличие брюшных рёбер. 2 Они расположены между грудиной и тазом под кожей и среди современных пресмыкающихся, кроме клювоголовых, сохранились только у крокодилов. 2
• Венозный синус в сердце. 24 Это специальное место для хранения венозной крови, которое отсутствует у других современных пресмыкающихся. 24