Некоторые особенности поверхности Ганимеда, которые позволяют предположить существование подлёдного океана:

• Наличие следов недавнего (по геологическим меркам) обновления поверхности. 3 Застывший лёд на некоторых участках выглядит так, будто ещё не успел пострадать от метеоритной бомбардировки. 3
• Большое количество хребтов и борозд. 25 Возможная причина их появления — таяние и смещение ледяной поверхности из-за приливного нагрева. 2
• Наличие полярных шапок, предположительно состоящих из водяного инея. 1 Они покрывают широты выше 40° и, вероятно, образованы молекулами воды, выбитыми с поверхности при бомбардировке её частицами плазмы. 1
• Собственная магнитосфера. 12 Ганимед — единственный спутник в Солнечной системе, обладающий собственной магнитосферой. 12 Скорее всего, её создаёт конвекция в жидком ядре, богатом железом. 1
• Многослойное строение недр. 1 Численное моделирование недр спутника, выполненное в 2014 году сотрудниками Лаборатории реактивного движения НАСА, показало, что жидкие слои разделены слоями льда разных типов. 1 Количество жидких прослоек, возможно, достигает 4, их солёность растёт с глубиной. 1