Корневые системы глубоководных растений имеют следующие особенности:

• Слабое развитие. 13 Корневые волоски отсутствуют, так как вода с растворёнными в ней минеральными веществами может проникать непосредственно в листья. 13
• Перистые корни. 13 Это связано с тем, что растениям не требуется поддержка в воде. 1
• Образование придаточных корней. 3 Они могут образовываться на побегах, корневищах, листьях, увеличивая тем самым площадь питания растения. 3
• Возможность закрепления корней на дне. 4 В некоторых случаях корни закрепляют на дне без применения грунта, зажимая между камнями. 4

Глубоководные растения могут получать питательные вещества одновременно из трёх источников — воды, земли и воздуха. 4