Некоторые особенности анатомии латимерии, которые делают её уникальной среди современных рыб:

• Специфические лопастные плавники. 23 В центре хвостового плавника имеется добавочная обособленная лопасть — рудимент хвоста древних форм. 1 Все остальные плавники латимерии, кроме переднего спинного, похожи скорее на лапы пресмыкающихся. 1
• Парные плавники, поддерживаемые костными поясами. 2 Они напоминают структуры, являющиеся эволюционными предшественниками плечевого и тазового поясов наземных четвероногих позвоночных. 2
• Нейрокраниум (мозговой череп) разделён внутренним суставом на переднюю и заднюю части. 2 Это позволяет рыбам открывать рот не только с помощью опускания нижней челюсти, но также поднимая верхнюю. 2
• Примитивное устройство сердца. 1 Оно имеет вид простой изогнутой трубки и не похоже на мускулистое, сильное сердце современных рыб. 1
• Наличие спирального клапана в кишечнике. 12 Это древнее приспособление замедляет продвижение пищи по кишечному тракту и увеличивает поверхность всасывания. 1
• Отсутствие газового пузыря. 5 Вместо него у латимерий есть пузырь, наполненный жировой тканью и выполняющий те же функции. 5