Существуют разные точки зрения на типы взаимодействия между грибами и лишайниками в природе. 35

Некоторые исследователи считают, что гриб и водоросль, из которых состоит лишайник, сосуществуют на взаимовыгодной основе (такой тип взаимоотношений называется мутуализмом). 25 Гриб обеспечивает водоросль водой и минеральными солями, а водоросль, в свою очередь, поставляет грибу органические вещества. 25

Другие учёные полагают, что гриб паразитирует на водоросли. 5 В нормальных условиях такой паразитизм не особенно обременителен для водоросли, но в некоторых случаях, например при воздействии частиц тяжёлых металлов, водоросль ослабевает, и гриб её полностью уничтожает, после чего лишайник погибает. 4

Таким образом, истинные взаимоотношения между компонентами лишайников до конца не выяснены. 5