Некоторые основные проблемы, которые возникают при изучении процесса коацервации в современных условиях:

• Влияние факторов на образование коацерватов. 2 На этот процесс влияют рН, ионная сила, температура, хиральность и структура заряда. 2 Например, полибетаины очень чувствительны к температуре при коацервации, поэтому размером и плотностью капель нужно управлять, меняя температуру в определённом диапазоне. 3
• Эффективность инкапсуляции. 4 Например, степень этерификации пектина значительно влияет на эффективность процесса коацервации. 4
• Точное воспроизведение единичных белковых структур. 1 В коацерватной гипотезе А. И. Опарина не решена проблема точного воспроизведения внутри коацервата и в поколениях единичных, случайно появившихся эффективных белковых структур. 1