Основные принципы работы метода ионного полупроводникового секвенирования:

1. Химические основы. 2 В каждую микролунку на полупроводниковом чипе, содержащую одноцепочечную молекулу ДНК-матрицы и ДНК-полимеразу, последовательно заливают дезоксирибонуклеотидтрифосфат (dNTP) одного вида. 12 Если введённый dNTP комплементарен следующему непарному нуклеотиду на матричной цепи, он включается в растущую комплементарную цепь с помощью ДНК-полимеразы. 12 Если введённый dNTP не комплементарен, реакции полимеризации не происходит. 1
2. Высвобождение ионов водорода. 13 Это происходит, когда dNTP включается в цепь. 2 Ион водорода изменяет рН раствора, что обнаруживается ионным датчиком ISFET. 13
3. Обнаружение сигнала. 13 Каждый выделившийся ион водорода вызывает срабатывание ISFET датчика. 1 Серия электрических импульсов, передаваемых от чипа к компьютеру, переводится в последовательность ДНК без промежуточного преобразования сигнала. 1
4. Обработка сигналов и сборка последовательности ДНК. 1 Это выполняется программно. 1