Основные преимущества ион-парной хроматографии по сравнению с ионной:

• Возможность достичь почти любой необходимой селективности. 1 То есть расположить пики на хроматограмме любым требуемым образом. 1
• Эффективность разделения. 2 Вследствие более быстрой массопередачи в ион-парной системе хроматографическое разделение более эффективно, чем на ионообменнике с фиксированными и активными зонами. 2
• Улучшение удерживания оснований и кислот. 3 В ион-парном режиме удерживание оснований и кислот заметно возрастёт, улучшится форма их хроматографических пиков. 3

Ион-парную хроматографию используют для разделения образцов, содержащих как ионные, так и неионные соединения. 2 Её применяют в тех случаях, когда трудно или невозможно получить приемлемое разделение образца методом ионообменной хроматографии. 2