Основные отличия между SystemException и ApplicationException в C#:

1. SystemException — базовый класс для исключений, генерируемых Common Language Runtime (CLR) или связанных с системой ошибок. 4 Эти исключения считаются неустранимыми фатальными ошибками. 2
2. ApplicationException — базовый класс для исключений, связанных с приложением. 4 При обработке исключения, унаследованного от ApplicationException, программист может полагать, что исключение было вызвано кодом функционирующего приложения, а не библиотекой базовых классов .NET или механизмом исполняющей среды .NET. 2

Таким образом, SystemException содержит стандартные системные исключения, а ApplicationException позволяет пользователям определять собственные конкретные исключения, связанные с бизнес-логикой приложения. 14