Основные отличия фанерозойского эона от более древних периодов:

• Наличие развитых многоклеточных фаун. 1 В более древних отложениях (докембрии) практически отсутствовали такие организмы, за исключением франсвильской, хуайнаньской и эдиакарской биотов. 1
• Коэволюция животных и растений. 12 В фанерозое появлялись животные, экологически связанные с определённой группой растений, и наоборот. 1
• Резкое увеличение числа биологических видов. 2 Это произошло в кембрийском периоде, когда появились организмы с минеральными скелетами, членистоногие и хордовые, а также образовались сложные формы растений. 2
• Большое разнообразие флоры и фауны. 1 Эра фанерозоя отличалась большим разнообразием флоры и фауны на Земле, которая, однако, сильно колебалась в разные периоды. 1