Основные направления деятельности ГКНПЦ имени М. В. Хруничева:

• Совершенствование существующих продуктов путём внедрения инновационных технологий в эксплуатируемые средства выведения (ракета-носитель «Протон-М» и разгонный блок «Бриз-М»). 2
• Создание новых инновационных продуктов. 2 К ним относятся семейство ракетоносителей «Ангара», кислородно-водородный разгонный блок КВТК, многоразовая ракетно-космическая система первого этапа МРКС-1, модули международной космической станции, новые типы маломассогабаритных космических аппаратов. 2
• Разработка и внедрение инновационных технологий и прогрессивных технологических процессов, обеспечивающих совершенствование существующих и создание новых продуктов предприятия. 2
• Техническое перевооружение опытного и серийного производства, стендовой испытательной базы, что создаёт основу для разработки и внедрения инновационных технологий и прогрессивных технологических процессов в серийное производство. 2
• Внедрение инноваций в управление бизнес-процессами, включающее создание единой корпоративной информационно-телекоммуникационной системы управления предприятием — ЕКИТСУП. 2
• Дистанционное зондирование Земли (ДЗЗ). 1 Реализация программы включает в себя создание космических аппаратов для исследований ближнего и дальнего космоса. 3