Основные функции лизосом в клетках животных:

• Внутриклеточное пищеварение. 1 Лизосомальные ферменты обеспечивают переваривание веществ, попадающих в клетку в процессе эндоцитоза, а также нейтрализацию питательных соединений и чужеродных агентов. 1
• Аутофагоцитоз. 1 Процесс расщепления ненужных клетке клеточных структур, которые осуществили свою функцию и должны покинуть клетку. 1
• Автолиз. 34 Саморазрушение клетки, приводящее к её гибели. 3 Данный процесс может быть как патологическим, так и физиологическим, сопровождая развитие организма или дифференцировку определённых специализированных клеток. 3

В растительных клетках многие функции лизосом выполняет центральная вакуоль. 4