Некоторые основные эксперименты, которые провёл Томас Морган для доказательства своей хромосомной теории:

1. Скрещивание мушки дрозофилы с серым телом и нормальными крыльями с мушкой, имеющей тёмное тело и зачаточные крылья. 2 В первом поколении получились гибриды, имеющие серое тело и нормальные крылья. 2 Ген, определяющий серую окраску тела, доминирует над геном, отвечающим за тёмную окраску тела, а ген, отвечающий за нормальное развитие крыльев, доминирует над геном, обусловливающим недоразвитость крыльев. 2
2. Анализирующее скрещивание самки гибрида 1-го поколения с самцом, имевшим рецессивные признаки. 2 Теоретически ожидалось получить потомство с комбинациями этих признаков в соотношении 1:1:1:1. 2 Однако в потомстве преобладали особи с признаками родительских форм: 41,5% — серые с нормальными крыльями и 41,5% — тёмные с зачаточными крыльями. 2
3. Скрещивание рецессивной по обоим признакам самки (чёрной с короткими крыльями) с дигетерозиготным самцом (серым с нормальными крыльями). 4 В потомстве появилось 50% чёрных мух с короткими крыльями и 50% мух с серым телом и нормальными крыльями. 4 Значит, гены, расположенные в одной хромосоме, наследовались совместно. 4
4. Скрещивание дигибридной самки (серой с нормальными крыльями) с гомозиготным рецессивным самцом (чёрным с короткими крыльями). 4 В этом случае потомство имело четыре фенотипа: 41,5% — серых с короткими крыльями, 41,5% — чёрных с нормальными крыльями, 8,5% — серых с нормальными крыльями, 8,5% — чёрных с короткими крыльями. 4 Морган пришёл к выводу, что сцепление может быть неполным и нарушается в результате кроссинговера — обмена участками между гомологичными хромосомами. 4