Некоторые трудности, с которыми столкнулся Д. И. Менделеев при разработке периодической таблицы:

• Ошибки в определениях атомных весов. 3 Атомные веса многих элементов, особенно металлов бериллия, церия, ванадия, титана, были в 1,5–2 раза меньше или больше истинных. 3
• Аномалии в последовательности изменения атомных весов некоторых элементов. 1 В трёх парах элементов: кобальт — никель, аргон — калий и теллур — йод, атомные веса предыдущих элементов оказывались большими, чем у последующих. 1
• Отсутствие группы благородных газов. 2 В то время благородные газы не были известны. 2
• Невозможность объяснить положение изотопов. 2 Атомы одного и того же элемента, обладающие сходными химическими свойствами, но разными атомными массами, были размещены в одной и той же группе. 2
• Неправильное положение водорода. 2 Водород относился как к группе щелочных металлов, так и к группе галогенов, поэтому периодический закон Менделеева не смог правильно расположить его в таблице. 2

Однако, несмотря на эти трудности, Д. И. Менделеев не сделал в своей таблице ни единой ошибки. 5 Учёный выработал принцип, исключающий подобные ошибки при нахождении и открытии новых элементов. 3