Некоторые ограничения применения алгоритма Хаффмана к источникам с энтропией меньше единицы:

• Эффективность кодирования резко снижается. 3 Это связано с тем, что действует ограничение снизу: средняя длина слов не может быть менее 1 бит/пиксел (в предельном случае, когда энтропия равна нулю). 3
• Минимальная длина кодового слова не может быть меньше единицы. 2 При этом энтропия сообщения может составлять и 0,1, и 0,01 бит/букву, и в этом случае код Хаффмана становится существенно избыточным. 2
• Непосредственное применение кода Хаффмана бессмысленно для источника с энтропией, не превышающей 1 (например, для двоичного источника). 1