Некоторые ограничения использования модели Бора в современной физике:

• Невозможность объяснения спектров более тяжёлых атомов. 3 Модель Бора может сделать предсказания о спектрах рентгеновского излучения K-альфа и некоторых L-альфа для более крупных атомов, но не может объяснить большую часть спектров. 3
• Невозможность описания многоэлектронных атомов. 13 Модель Бора не работает для гелия, который включает в себя два электрона, и других многоэлектронных частиц. 1
• Нарушение принципа неопределённости. 3 Модель считает, что электроны имеют известные орбиты и местоположения — две вещи, которые невозможно измерить одновременно. 3
• Невозможность объяснения тонкой и сверхтонкой структуры в спектральных линиях. 3 Эти структуры обусловлены множеством релятивистских и тонких эффектов, а также осложнениями, связанными со спином электронов. 3
• Невозможность объяснения эффекта Зеемана. 3 Это изменение спектральных линий под действием внешних магнитных полей, которое связано с более сложными квантовыми принципами, взаимодействующими со спином электрона и орбитальными магнитными полями. 3

Со временем интуитивная гипотеза Бора уступила место строгой систематической формулировке в рамках законов квантовой механики. 2 Однако из-за своей простоты и правильных результатов для выбранных систем модель Бора по-прежнему используется для ознакомления студентов с квантовой механикой. 3