Некоторые ограничения боровской модели атома по сравнению с современными теориями:

• Невозможность объяснить большую часть спектров более тяжёлых атомов. 1 В лучшем случае модель может сделать предсказания о спектрах рентгеновского излучения K-альфа и некоторых L-альфа для более крупных атомов, если будут сделаны два дополнительных специальных предположения. 1
• Отсутствие объяснения эффекта Зеемана. 12 Изменение спектральных линий под действием внешних магнитных полей связано с более сложными квантовыми принципами, взаимодействующими со спином электрона и орбитальными магнитными полями. 1
• Нарушение принципа неопределённости. 1 Модель считает, что электроны имеют известные орбиты и местоположения — две вещи, которые невозможно измерить одновременно. 1
• Невозможность объяснить, почему некоторые энергетические уровни должны располагаться очень близко друг к другу. 1
• Отсутствие энергетических уровней, предсказываемых моделью, у многоэлектронных атомов. 1 Например, она не работает для (нейтрального) гелия. 1

С позиции современной физики атом является физической системой, которая не может быть описана классической теорией, не учитывающей волновых свойств движущегося в атоме электрона. 4