Некоторые недостатки использования парафиновой заливки в гистологии:

• Значительное сжатие исследуемого материала (до 20%) в процессе пропитывания парафином. 1
• Малопригодность к заливке в парафин богатых водой, рыхлых тканей. 1
• Необходимость удаления парафина из срезов перед их окраской, так как он не обладает достаточной прозрачностью и затрудняет процесс окрашивания. 2
• Возможные погрешности при изготовлении парафиновых срезов, например, срез крошится, залитый материал в процессе резки выпадает из окружающей массы парафина, срезы закручиваются, прилипают к поверхности ножа, мнутся. 2

Выбор метода зависит от конкретных задач и требований к препарату.