Некоторые недостатки камеры Вильсона, которые сделали её менее востребованной в современной науке:

• Малое рабочее время. 24 Оно составляет примерно 1% от времени, которое требуется для подготовки камеры к последующему расширению (выравнивание температуры и давления, рассасывание остатков треков, насыщение паров). 24
• Трудоёмкость обработки результатов. 24
• Затруднения при работе с камерой при высоких давлениях. 5 Необходимо очищать камеру от капель, оставшихся после расширения, и с ростом давления увеличивается время нечувствительности (мёртвое время). 5

Однако, несмотря на эти недостатки, камера Вильсона всё ещё используется в некоторых отраслях, так как имеет меньшую стоимость по сравнению с более прогрессивными детекторами. 1