Некоторые недочёты теории Дарвина:

• Невозможность объяснить зарождение жизни. 29 Теория Дарвина объясняет развитие уже появившейся жизни, а не её появление. 2
• Незнание механизмов наследственности. 58 Дарвин думал, что разные признаки «растворяются» при скрещивании, но с развитием генетики учёные выяснили, что признаки наследуются целиком и могут по-разному сочетаться в потомстве. 8
• Отсутствие объяснения нейтральных признаков. 3 Дарвин не придавал особого значения бесполезным и безвредным вариациям, но современная наука добавила к его теории понятие «нейтральные признаки». 3

Теория Дарвина не полностью объясняет происхождение человека, потому что трудно впрямую объяснить происхождение человека от других видов. 2 Например, археологи не всегда находят промежуточные варианты между человеком и приматом. 8

Однако стоит отметить, что теория Дарвина не является доминирующей в науке, и на смену ей пришла синтетическая теория эволюции, которая включает в себя исследования в сфере генетики и палеонтологии. 7