Некоторые научные исследования, которые проводятся в подземных пещерах:

• Изучение биологии и эволюции. 3 В пещерах обитают организмы, адаптированные к полной темноте. 3 Например, в пещерах острова Новой Гвинеи была найдена экосистема, включающая ранее неизвестные виды, а также утраченные наукой за десятилетия птицы. 3
• Исследование устойчивости микроорганизмов к антибиотикам. 3 Также учёные изучают возможность фотосинтеза в условиях инфракрасного света. 3 Эти данные помогают исследовать возможность жизни на других планетах, например, в пещерах на Марсе. 3
• Изучение прошлого Земли. 3 Пещеры содержат уникальные свидетельства о древних климатических изменениях и останках давно исчезнувших видов. 3
• Обнаружение скрытых пространств. 5 Например, в пещерах Успенского Псково-Печерского монастыря учёные обнаружили множество неведомых ранее подземных улиц, огромных склепов и других пространств со сводами. 5 Это стало возможным благодаря методу мюонографии — регистрации потоков космических частиц, по которым потом и создают 3D-модели подземных объектов. 5