Некоторые научные и производственные центры, которые входят в состав Московской агломерации:

• Дубна. 14 Научные предприятия города специализируются на исследованиях в области ядерной физики. 4
• Королёв. 24 Здесь находится Центр управления полётами, откуда управляют российским сегментом Международной космической станции (МКС). 4 Также в городе работают другие научно-производственные объединения с уникальной экспериментально-испытательной базой. 2
• Реутов. 2 В городе действуют десять известных научно-исследовательских центров, в том числе Институт земного магнетизма, ионосферы и распространения радиоволн им. Н. В. Пушкова (ИЗМИРАН), Троицкий Институт инновационных и термоядерных исследований (ТРИНИТИ) и другие. 2
• Черноголовка. 2 В состав научного центра города входят несколько институтов Российской академии наук, а также научно-производственные предприятия. 2 Область исследований включает химическую физику процессов горения и взрыва, физику конденсированных сред, микро- и наноэлектронику, медицину, современное материаловедение и геологию. 2