В качестве показателей фекального загрязнения почвы используются следующие микроорганизмы:

• БГКП (бактерии группы кишечной палочки). 14 Выявление этих бактерий и клостридий свидетельствует о фекальном загрязнении почвы. 1
• Streptococcus faecalis (фекальные стрептококки) или Escherihia coli (грамотрицательная кишечная палочка). 2 Наличие этих бактерий говорит о свежем фекальном загрязнении. 2
• Clostridium perfringens (возбудитель токсикоинфекций). 2 Присутствие этого микроорганизма определяет давнее загрязнение. 2

Также для оценки санитарного состояния почвы используются термофильные бактерии, которые помогают выяснить характер и давность органического загрязнения, и нитрифицирующие бактерии, появление которых указывает на развитие процесса самоочищения. 14