Некоторые методы выделения ДНК из лизатов клеток, которые применяются в современной молекулярной биологии:
- Выделение с помощью магнитных микрочастиц. 2 К лизату добавляют специальные намагниченные шарики (на основе оксидов железа и никеля). 2 Молекулы ДНК облепляют магнитные шарики, и такую ДНК легко собрать с помощью подведения магнита к стенке микропробирки. 2
- Выделение при помощи спин-колонок. 34 После лизиса образец переносят в спин-колонку. 3 Во время центрифугирования лизат частично проходит через кремниевый фильтр, при этом нуклеиновые кислоты остаются в спин-колонке. 3 К ним добавляют этанол для осаждения и очищения. 3
- Выделение нуклеиновых кислот при помощи высаливания. 3 К клеточному лизату добавляют солевой буфер, что приводит к осаждению белков и других клеточных компонентов после центрифугирования. 3 Далее полученный супернатант с нуклеиновыми кислотами переносят в новую пробирку. 3
- Фенол-хлороформный метод экстракции ДНК. 5 Считается стандартным. 5 Для лизиса клеток и денатурации белков часто используют детергент додецилсульфат натрия или хаотропный агент гуанидинизотиоцианат. 5
- Метод с использованием CTAB-буфера. 4 Он хорошо справляется с высоким содержанием полисахаридов и полифенолов в растительных тканях. 4
Часто эффективным оказывается сочетание разных методов. 1 Универсальных протоколов нет, и оптимальный метод подбирают в зависимости от образца ткани. 2