Некоторые методы, которые используются для установления причинно-следственных связей в научных работах:

• Рандомизированные контролируемые исследования (РКИ). 1 Испытуемых случайно распределяют в группу лечения и контрольную группу, что позволяет исследователям приписывать наблюдаемые различия лечению или вмешательству. 1
• Естественные эксперименты. 1 В них используют естественные события или условия, имитирующие контролируемые эксперименты. 1
• Обсервационные исследования. 1 Анализируют существующие данные для выявления ассоциаций, которые намекают на причинно-следственную связь. 1 При этом важно тщательно контролировать наличие смешивающих переменных — внешних факторов, которые могут исказить связь. 1
• Инструментальные переменные, моделирование структурными уравнениями и различные статистические методы. 1 Они помогают выявлять причинно-следственные связи из сложных наборов данных. 1

Также для установления причинно-следственных связей используют логические методы, разработанные Ф. Бэконом и окончательно доработанные Дж. Миллем: 35

• Метод сходства. 35 Определяют все случаи, когда возникало явление, причину которого предстоит выявить. 2 Затем анализируют каждый случай и выделяют обстоятельства, ассоциированные с появлением явления. 2 После этого находят обстоятельство, общее во всех рассмотренных случаях. 2 Именно его признают причиной явления. 2
• Метод различия. 35 Исследуют два случая, в одном из которых явление наступило, а в другом нет. 2 Затем сравнивают эти случаи и выявляют, какие обстоятельства им предшествовали. 2 После этого находят общие обстоятельства и то, какое обстоятельство отсутствовало в случае ненаступления явления. 2 Это обстоятельство, вероятно, и выступает причиной явления. 2
• Объединённый метод сходства и различия. 2 Рассматривают несколько случаев наступления явления и выявляют сходство обстоятельств в этих случаях (общее обстоятельство — кандидат на роль причины). 2 Затем рассматривают несколько случаев ненаступления явления. 2 Они отличаются от первой группы отсутствием обстоятельства, рассматриваемого как кандидат на роль причины. 2 На основании этого делают вывод, что обстоятельство, общее для первой группы случаев и отсутствующее во второй группе, и есть искомая причина. 2
• Метод сопутствующих изменений. 2 Рассматривают случай, в котором возникло явление, выясняя присущие ему обстоятельства. 2 Затем последовательно меняют одно из обстоятельств, каждый раз фиксируя, произойдут ли изменения в явлении. 2 Если для какого-либо обстоятельства после каждого изменения статуса (наличие/отсутствие) менялся и факт наблюдения явления, можно предположить, что оно и есть причина для этого явления. 2
• Метод остатков. 2 Признан самым слабым методом научной индукции. 2 Однако он удобен, если работа ведётся со сложными обстоятельствами, влекущими сложные следствия. 2 Общее правило метода остатков: если сложные обстоятельства обусловливают сложное явление и известно, что часть обстоятельств вызывает определённую часть этого явления, то оставшиеся обстоятельства вызывают оставшуюся часть явления. 2