Какие методы секвенирования используются для обнаружения генетически модифицированных организмов?

Для обнаружения генетически модифицированных организмов (ГМО) используют различные методы секвенирования, в том числе:

• Секвенирование нанопор. www.frontiersin.org Позволяет проводить прямое секвенирование последовательностей ДНК или РНК без сложных этапов предварительной обработки. www.frontiersin.org Метод подходит для обнаружения сложных событий рекомбинации генов и структурных вариантов генома. www.frontiersin.org
• Секвенирование нового поколения. cyberleninka.ru Позволяет определять последовательность как всего генома, так и отдельных его участков, где может находиться трансген. cyberleninka.ru Однако метод не получил широкого распространения из-за высокой стоимости оборудования и обработки данных. cyberleninka.ru
• Секвенирование одиночных молекул ДНК (Single molecule real time sequencing, SMRT). www.voprosy-pitaniya.ru Не требует проведения клональной амплификации или синтеза цепи и позволяет избежать искажений, возникающих при копировании тестируемого материала. www.voprosy-pitaniya.ru

Кроме того, для идентификации ГМО используют методы на основе нуклеиновых кислот, в частности полимеразной цепной реакции (ПЦР). www.frontiersin.org К ним относятся, например, ДНК-блоттинг, количественная флуоресцентная ПЦР в реальном времени, капельная цифровая ПЦР и другие. www.frontiersin.org