Для обнаружения генетически модифицированных организмов (ГМО) используют различные методы секвенирования, в том числе:
- Секвенирование нанопор. 1 Позволяет проводить прямое секвенирование последовательностей ДНК или РНК без сложных этапов предварительной обработки. 1 Метод подходит для обнаружения сложных событий рекомбинации генов и структурных вариантов генома. 1
- Секвенирование нового поколения. 2 Позволяет определять последовательность как всего генома, так и отдельных его участков, где может находиться трансген. 2 Однако метод не получил широкого распространения из-за высокой стоимости оборудования и обработки данных. 2
- Секвенирование одиночных молекул ДНК (Single molecule real time sequencing, SMRT). 4 Не требует проведения клональной амплификации или синтеза цепи и позволяет избежать искажений, возникающих при копировании тестируемого материала. 4
Кроме того, для идентификации ГМО используют методы на основе нуклеиновых кислот, в частности полимеразной цепной реакции (ПЦР). 1 К ним относятся, например, ДНК-блоттинг, количественная флуоресцентная ПЦР в реальном времени, капельная цифровая ПЦР и другие. 1