Некоторые методы, которые применяются в популяционной генетике для анализа генетической структуры популяций:

• Молекулярные маркеры. 1 Например, ПЦР (полимеразная цепная реакция) позволяет амплифицировать специфические участки ДНК, что упрощает анализ генетического материала. 1 Также для оценки генетического разнообразия используются микросателлиты (повторяющиеся последовательности ДНК) и SNP (однонуклеотидные полиморфизмы). 1
• Секвенирование ДНК. 1 Секвенирование всего генома (WGS) даёт полную информацию о генетическом материале организма и помогает оценить генетическое разнообразие на уровне всего генома. 1 Секвенирование целевых участков (например, митохондриальной или хлоропластной ДНК) используется для изучения филогении и структуры популяций. 1
• Генетическая аналитика. 1 Для этого применяется программное обеспечение, которое позволяет анализировать генетическое разнообразие и структуру популяций на основе молекулярных данных. 1
• Филогенетические методы. 1 Создаются филогенетические деревья для изучения эволюционных связей между популяциями и их предками. 1 Также проводится сравнительная геномика — сравнение геномов разных видов или популяций для выявления генетических различий и общих признаков. 1
• Методы статистического анализа. 1 Проводится анализ распределения значений признаков и частот аллелей в популяциях. 1 Метод позволяет изучить генетическую структуру популяций и закономерности географического распространения генов. 1
• Байесовские алгоритмы кластеризации. 3 Эти методы используют генетическую информацию для определения популяционной принадлежности особей, не предполагая заранее определённых популяций. 3 Они могут отнести либо особей, либо часть их генома к ряду кластеров на основе мультилокусных генотипов. 3