При исследовании клеток растений под световым микроскопом используют различные красители, которые обладают определённой избирательностью и делают видимыми отдельные компоненты клетки. 1

Некоторые методы окрашивания и используемые красители:

• Гематоксилин. 12 Окрашивает некоторые компоненты ядра в синий или фиолетовый цвет. 1
• Флороглюцин и соляная кислота. 12 После обработки одревесневшие оболочки клеток становятся вишнево-красными. 1
• Судан III. 1 Окрашивает опробковевшие клеточные оболочки в розовый цвет. 1
• Слабый раствор йода в йодиде калия. 1 Окрашивает крахмальные зёрна в синий цвет. 1
• Фуксин. 2 Используется для окрашивания цитоплазмы. 2
• Хлор-цинк-йод. 2 Применяется для окрашивания целлюлозных клеточных оболочек. 2

Перед окраской большую часть тканей фиксируют. 1 После фиксации клетки становятся проницаемыми для красителей, а структура клетки стабилизируется. 1 Одним из наиболее распространённых фиксаторов в ботанике является этиловый спирт. 1