Для выделения митохондриальной ДНК из животных клеток используются различные методы, например:

• Центрифугирование. 1 Метод основан на разделении объектов разной плотности или массы за счёт разной скорости оседания объектов (за счёт разной скорости вращения центрифуги). 1 Митохондриальная фракция получается после осаждения ядер как самых плотных (тяжёлых) клеточных структур (плотность митохондрий ниже плотности ядер, но выше плотности всех остальных структур). 1
• Экстракция растворителями. 3 Используется для удаления примесей из нуклеиновых кислот. 3 Например, комбинация растворителей фенол — хлороформ применяется для удаления белков. 3
• Осаждение. 3 Для концентрирования нуклеиновых кислот применяется осаждение изопропанолом или этанолом. 3
• Хроматография. 3 Используются различные технологии разделения, такие как гель-фильтрация, ионообменная хроматография, селективная адсорбция или аффинное связывание. 3