Некоторые методы, которые используются для визуализации молекул в электронных микроскопах:

• Криоэлектронная микроскопия. 1 За основу взят метод визуализации полимерных структур, но вместо льда для защиты молекул используется графен — углеродный слой толщиной в атом. 1 Это позволяет стабилизировать малые молекулы. 1 Также исследователи сокращают интенсивность электронного пучка микроскопа: в новом методе используется в миллион раз меньше электронов, чем обычно. 1
• Одномолекулярная микроскопия. 4 В этом методе интенсивность луча подбирается таким образом, чтобы среднее расстояние между одиночными «засветившимися» молекулами было равно дифракционному пределу. 4 Благодаря этому каждое сфотографированное микроскопом светящееся пятно представляет собой одиночную молекулу. 4 Далее компьютер точно вычисляет координаты молекулы, образовавшей каждое пятно. 4

Также для визуализации в просвечивающей электронной микроскопии (ПЭМ) используются дифракционный контраст, фазовый контраст и сканирующая просвечивающая электронная микроскопия (СПЭМ). 5