Некоторые методы, которые используются для типирования бактерий:

• Анализ полиморфизма длин рестрикционных фрагментов (ПДРФ). 2 Бактериальную ДНК обрабатывают рестриктазами и анализируют с помощью электрофореза. 2 Степень генетического родства сравниваемых изолятов оценивают по количеству и расположению рестрикционных фрагментов (полос на электрофорезе). 2
• Мультилокусное секвенирование (MLST). 2 Заключается в секвенировании определённого набора генов (обычно 6–7 генов). 2 В результате каждый штамм характеризуется специфическим «аллельным профилем» по выбранным локусам. 2 Сравнение полученных данных между собой, выяснение эволюционных связей между штаммами, их генетического расстояния производится с использованием специализированного программного обеспечения. 2
• ПЦР-анализ. 4 Один из основных методов молекулярно-генетического типирования бактерий. 4 При использовании ПЦР анализируется непосредственно ДНК бактерий. 4 В результате становится возможным выявление их индивидуальных генотипических особенностей даже в том случае, если фенотипические различия не были обнаружены. 4