Какие методы используются для реконструкции филогении прокариотических организмов?

Некоторые методы, которые используются для реконструкции филогении прокариотических организмов:

• Числовая таксономия. mz-don.com meduniver.com Основана на сравнении ряда характеристик, таких как присутствие или отсутствие капсульного слоя, дифференциальное окрашивание по Граму, требования к кислороду, сходство нуклеиновых кислот и белков, способность к спорообразованию, подвижность и наличие или отсутствие некоторых ферментов. mz-don.com Исследование этих показателей позволяет оценить степень сходства или различия между микробами. mz-don.com
• Молекулярная филогения. mz-don.com meduniver.com Предполагает, что эволюционные различия между организмами проявляются в вариациях их наследственного материала. mz-don.com Для анализа используют, например, степень сходства последовательностей РНК малых субъединиц рибосом (SSU rRNA), которая указывает на их эволюционную близость. mz-don.com meduniver.com
• Метод максимальных общих интервалов (MCI). pubmed.ncbi.nlm.nih.gov Позволяет определить расстояние между геномами и реконструировать их эволюционную взаимосвязь. pubmed.ncbi.nlm.nih.gov Также для этого используют меры, основанные на необычных сегментах (UC) — геномных сегментах, которые не обнаружены ни в одном из MCI. pubmed.ncbi.nlm.nih.gov