Какие методы используются для реконструкции эволюционных родословных?

Для реконструкции эволюционных родословных используются различные методы, в том числе:

• Методы, основанные на расчёте матрицы молекулярных расстояний. 2 К ним относятся, например, UPGMA (метод невзвешенной попарной группировки с усреднением) и метод ближайшего соседа. 25
• Методы, основанные на учёте отдельных событий. 2 К ним относятся метод парсимонии (метод экономии числа событий) и метод максимального правдоподобия. 2
• Методы, рассматривающие признаки. 5 Они реконструируют дерево, используя информацию из каждой позиции выравнивания, а не последовательности в целом. 5 К таким методам относится, например, метод максимальной бережливости. 5
• Байесовский анализ. 3 Метод использует байесовскую статистику для оценки вероятности деревьев. 3
• Вероятностные модели эволюции. 5 К ним относятся, например, модель Джукса-Кантора и модель Кимуры. 5

Выбор метода зависит от типа данных, доступных для анализа, и целей исследования. 3