Для отбора проб керна в разных средах используют различные методы, среди них:

• Гравитационный отбор керна. 1 Керноотборник опускается в пробу, обычно на дно водоёма, но метод может применяться и к мягким материалам на суше. 1
• Вибрационный отбор керна. 1 Пробоотборник подвергается вибрации для обеспечения проникновения в тиксотропную среду. 1
• Разведочное алмазное бурение. 1 Вращающийся кольцевой инструмент, подкреплённый цилиндрическим устройством для хранения образцов керна, прижимается к исследуемым материалам для вырезания цилиндра из материала. 1
• Колонковое бурение. 2 Керн отбирают с помощью специального устройства — кернового снаряда. 2 Как правило, используют буровой раствор и механизм для отрыва и удержания отобранного керна в инструменте при подъёме на поверхность. 2
• Отбор из стенки скважины стреляющими керноотборниками. 2 Для отбора используют прочные цилиндрические гильзы, которые при выстреле врезаются в стенку скважины. 2
• Метод кольцевого плавления. 2 Керн отбирают из ледяных массивов, например на полярных станциях. 2

В зависимости от консистенции и состава исследуемых материалов в инструментах для бурения керна могут потребоваться различные приспособления для поддержки и защиты образца на пути к поверхности. 1