Некоторые методы, которые используются для определения последовательности аминокислот в полипептиде:

• Метод Эдмана. 5 Исследуемый пептид обрабатывают определённым набором реагентов, что приводит к отщеплению одной аминокислоты с N-конца последовательности. 5 Циклическое повторение реакции и анализ продуктов реакций дают информацию о последовательности аминокислот в пептиде. 5
• Масс-спектрометрическое секвенирование. 4 Пептид подают в источник ионов, где фрагментируют его молекулярный ион при помощи изменения электрического поля. 4 Далее ионы разделяют в масс-анализаторе и направляют в детектор, где осуществляют регистрацию масс-спектра пептида и его фрагментов с различной глубиной фрагментации одновременно в одном спектре. 4 Масс-спектры фрагментов пептида обрабатывают системой регистрации и анализируют, в результате чего определяют аминокислотную последовательность исходного пептида. 4