Для определения супервторичной структуры белков используют, например, такие методы:
- Спектроскопия кругового дихроизма (КД). 2 Метод применяют для анализа интегральных параметров вторичной структуры глобулярных белков. 2 Он основан на предположении, что вид спектра в дальней ультрафиолетовой области зависит от локальной конформации полипептидной цепи. 2
- Метод молекулярной динамики. 13 С его помощью проверяют устойчивость обнаруженных структурных мотивов. 1 Для моделирования динамики используют, например, пакет программ AMBER 11. 3
- Конформационный подход. 1 При этом методе каждого остатка оценивают по карте Рамачандрана. 1
- Спектрально-аналитический метод. 1 Основная цепь белковой молекулы представляется в виде непрерывной аналитической кривой в трёхмерном пространстве. 1
- Геометрический подход. 1 Используют для распознавания, например, уголков с длинной перетяжкой. 1
- Метод рентгеноструктурного анализа. 4 С его помощью получают пространственную структуру белка с помощью рентгеновского дифрактометра. 4