Некоторые методы, которые используются для определения третичной структуры белков:

• Рентгеновский анализ. 34 С его помощью, например, определили вторичную и третичную структуру миоглобина и предложили модель его молекулы. 4
• Методы моделирования ab initio. 1 Они создают трёхмерные белковые модели «с нуля», основываясь на физических принципах, а не на экспериментально полученных данных о структурах. 1
• Сравнительное (гомологическое) моделирование. 1 Пространство поиска сокращается за счёт предположения, что рассматриваемый белок принимает структуру, близкую к экспериментально определённой структуре другого гомологичного белка. 1
• Методы, основанные на машинном обучении. 1 Они позволяют анализировать большое число возможных взаимодействий, так как для работы используются только аминокислотные последовательности. 1