Для обнаружения бактерий, не имеющих клеточной стенки, используются следующие методы:

• Окраска по Цилю-Нельсену. 1 Позволяет выявить кислотоустойчивые бактерии, к которым относятся и микоплазмы, не имеющие клеточной стенки. 14
• Окрашивание аурамином. 4 При поглощении кислотоустойчивыми бактериями аурамина вместо фенол-фуксина они излучают флуоресцентное свечение на тёмном фоне после возбуждающего воздействия УФ-излучением. 4
• Электронная микроскопия. 5 Для исследования в электронном микроскопе используют срезы бактерий толщиной 20–100 нм. 5 Такие ультратонкие срезы получают путём заливки исследуемого материала в эпоксидные смолы и разрезания полученных блоков на специальных микротомах. 5