Для изучения строения растений на разных уровнях увеличения используются различные методы, среди них:

• Сравнительно-морфологический. 12 Суть метода — сопоставление сходства и различий в строении представителей разных групп растений. 2 Это позволяет судить об истории их формирования и развития, проследить родственные связи. 2
• Палеоботанический. 2 Метод основан на изучении ископаемых остатков растений. 2
• Онтогенетический. 2 Позволяет на основе индивидуального развития растений представить пути их исторического развития. 2
• Физиолого-биохимический. 2 Устанавливает родство растений на основе сходства их химического состава. 2
• Цитологический. 2 Основан на специфичности хромосомного аппарата каждого вида. 2
• Молекулярно-генетический. 2 Базируется на изучении нуклеотидной последовательности наследственного материала. 2
• Физические методы. 3 Позволяют выделять клеточные компоненты (органеллы, мембраны, клеточную оболочку и др.) и выявлять их тончайшее строение (крахмальные зёрна, микрофибриллы целлюлозы и др.). 3
• Методы химии и биохимии. 3 Позволяют изучать химический состав и функции внутренних структур растений, устанавливать местонахождение конкретных веществ в клетке. 3

Также для изучения строения растений на разных уровнях увеличения используются световые и электронные микроскопы. 34 Например, сканирующий электронный микроскоп позволяет получать трёхмерное изображение поверхностных структур при очень больших увеличениях. 4