Для изучения отолитов в палеонтологии используются следующие методы:

• Стандартная методика работы с микропалеонтологическим материалом. 3 Применяется для извлечения отолитов из породы. 3
• Морфологический и морфометрический анализ. 23 Используется для видовой диагностики. 3 Измеряют максимальную длину вдоль переднезадней оси, ширину вдоль дорсовентральной оси, периметр и площадь отолита. 2
• Биостратиграфический метод. 3 Применяется для решения стратиграфических задач. 3

Также в последние годы всё большую популярность приобретают методы микрохимии отолитов, такие как спектрометрический и изотопный анализ. 1 Это связано с тем, что химический состав отолитов зависит от состава окружающей среды — в большей степени от её минерализации, в меньшей степени от температуры среды и от питания рыбы. 1