Для изучения взаимодействия аллельных генов используются следующие методы:

1. Гибридологический метод. 14 Основан на скрещивании организмов между собой с последующим математическим анализом расщепления признаков в потомстве. 1 Метод позволяет определить тип наследования признака и получить организмы с новыми комбинациями признаков. 1
2. Генеалогический метод. 14 С учётом встречаемости изучаемого признака у предков составляют родословную, по которой можно определить тип наследования признака и сделать вывод о вероятности появления изучаемого признака у потомков. 1
3. Цитогенетический метод. 14 С помощью микроскопа изучают кариотип организма — количество, размеры и форму хромосом. 1 Полученные результаты сравнивают с существующей нормой, что позволяет сделать вывод о наличии или отсутствии мутаций. 1
4. Близнецовый метод. 14 У близнецов одинаковый генотип, а выраженность генов в фенотипе может отличаться из-за различий в среде обитания. 1 Изучая близнецов, живущих в разных условиях среды, делают вывод о влиянии среды на проявление конкретного гена в признаке. 1