Некоторые методы, которые используются для изучения взаимодействия лигандов с белками:

• Молекулярный докинг. 13 Алгоритмы рассматривают молекулы лиганда и мишени как твёрдые тела или допускают возможность конформационных изменений в лиганде при его связывании. 1
• Молекулярная динамика (МД). 13 Метод основан на использовании уравнений движения атомов и эмпирических функций потенциальной энергии для расчёта межатомных взаимодействий и описания эволюции молекулярной системы во времени. 1
• Глубокое обучение. 1 Преимущество этого метода в том, что он позволяет изучать белок-лигандное взаимодействие непосредственно из пространственного расположения атомов. 1
• Спектроскопия ЯМР. 5 По изменению физических параметров ЯМР сигналов лиганда судят об образовании белок-лигандного комплекса. 5
• Изотермическая титрационная калориметрия (ИТК). 4 Метод основан на прямом измерении температуры в системе взаимодействующих молекул. 4
• Микротермофорез. 4
• Поверхностный плазмонный резонанс (ППР). 4