Некоторые методы, которые используются для анализа генетической сегрегации:

• Классический сегрегационный анализ. 2 Позволяет анализировать наследование признаков у модельных объектов (лабораторная мышь, дрозофила и т. д.). 2 Для него сегрегационный анализ проводится по материалу, полученному в ходе гибридологического эксперимента. 2
• Комплексный сегрегационный анализ. 25 Нацелен на анализ признаков человека. 2 Материалом для такого анализа являются выборки родословных, полученные при обследовании популяций. 2 Метод позволяет извлекать генетическую информацию из подобных данных. 2

Также для проверки генетических гипотез используются два статистических метода: 3

1. Подсчитываются ожидаемые численности различных фенотипических классов и сравниваются с наблюдаемыми. 3
2. Оценивается сегрегационная частота и сравнивается с ожидаемой. 3