Какие методы используются для анализа биологических последовательностей?

Некоторые методы, которые используются для анализа биологических последовательностей:

• Выравнивание последовательностей. www.progkids.com core.ac.uk Это основной инструмент биоинформатики, который помогает устанавливать структурные, функциональные и эволюционные отношения между последовательностями. core.ac.uk Выделяют два типа выравнивания: попарное (сравнение двух последовательностей) и множественное (сравнение трёх и более). www.progkids.com
• Методы, основанные на частоте слов. genomebiology.biomedcentral.com Они работают на основе того, что похожие последовательности содержат похожие слова, а математические операции с вхождениями слов дают относительную меру различия последовательностей. genomebiology.biomedcentral.com
• Методы, основанные на теории информации. genomebiology.biomedcentral.com Они распознают и вычисляют объём информации, которой обмениваются две анализируемые биологические последовательности. genomebiology.biomedcentral.com
• Метод точечных матриц. core.ac.uk Позволяет найти все возможные совпадения остатков между двумя последовательностями и предоставляет исследователю возможность выбора самых ценных из них. core.ac.uk
• Методы машинного обучения. scfh.ru Используются для предсказания структуры белка по его аминокислотной последовательности. scfh.ru
• Молекулярное моделирование структур биологических макромолекул. scfh.ru Алгоритмы, использующие технологии параллельных вычислений на высокопроизводительных компьютерных кластерах, позволяют рассчитывать системы, состоящие из десятков тысяч атомов. scfh.ru